游戏中的武器系统与角色的反应、技术能力、肉体等属性以及对应的专长技能紧密相关，例如专注于刀剑的近战流派、擅长潜行狙击的远程流派或是依赖智能武器锁定的突击流派，它们各自都有其最为适配的武器类型，错误搭配会导致战斗效率低下。
不同定位的武器均有表现出色的代表。对于偏好潜行与高额单体伤害的玩家，带有消音功能的狙击步枪守望是极佳的选择，它能让你在隐匿中解决目标。在技术武器中，猫又狙击步枪以其极快的充能速度和穿墙能力被誉为该类别中的佼佼者。突击步枪方面，阿贾克斯因其稳定的性能受到推荐，而分则能成作为一把智能突击步枪，能够同时追踪多个目标。手枪的选择则更加多样，马洛里安武器公司3516（强尼的手枪）、退路以及动能左轮大木大木都在各自细分领域有着强大的实战表现。
在近战武器领域，刀剑流派的核心武器是觉，这把武士刀虽然基础攻击力并非最高，但其翻倍的暴击伤害潜力巨大，在正确的技能搭配下能打出毁灭性的攻击，是追求极限近战输出的首选。尽忠丸、手术刀等不朽级别的刀剑也各有特色。对于喜欢重型打击感的玩家，钝器如镀金棒球棍或要人命链锯剑也提供了强有力的攻坚选项。
武器的获取与培养是发挥其威力的关键。游戏中有大量的不朽武器，它们具有独特的外观和特效，是许多流派的毕业装备。这些武器通常通过完成特定的主线或支线任务、击败重要角色、探索地图或从特定商贩处购买获得，部分武器如果错过，后期也可以在狗镇区域的黑市商人处弥补。获得武器后，通过技术能力对其升级、改造并安装合适的插件（如增加暴击伤害、暴击率或特定元素伤害的插件），是提升武器性能、使其伴随角色成长至终局的核心手段。
