通关四之岛的核心条件是先完成一周目主线剧情并收集60种以上宝可梦图鉴。返回真新镇找大木博士升级全国图鉴后，前往一之岛灯火山山洞取得红宝石交给博士，获得前往四之岛的船票。从枯叶市港口乘船即可抵达四之岛，这是解锁七之岛区域的重要节点。
四之岛的主要任务是解决火箭队残余势力并获取蓝宝石。登岛后需先前往岛屿右上角的遗迹山谷，穿过绿色小径和森林区域，在尽头洞穴内解开推石机关谜题。洞穴内部为多层迷宫结构，需按特定路线行进：上、左、右、下，最终取得蓝宝石时会被火箭队成员抢夺，需记下对方透露的仓库密码。
返回五之岛火箭队仓库输入密码，击败内部所有火箭队成员后夺回蓝宝石。其中仓库B4层需要击败看守电梯的火箭队干部，取得钥匙后通过传送装置抵达核心区域。战斗建议携带格斗系或地面系宝可梦应对火箭队常见的毒系和电系阵容。夺回蓝宝石后需将其送回一之岛研究所完成通讯系统修复。
四之岛后续可探索区域包括训练师塔和变化洞穴。训练师塔位于岛屿东南部，内部设有连续对战关卡，挑战成功后能获得稀有道具。变化洞穴需使用冲浪术抵达，内部环境会随游戏时间改变出现不同属性的野生宝可梦。完成蓝宝石任务后，六之岛和七之岛将同步解锁，为捕捉急冻鸟和超梦等传说宝可梦做准备。
通关过程中需注意月见山取得的化石复活后，镰刀盔与菊石兽的战术价值差异。前者物理攻击突出适合速攻，后者特防能力优异适合消耗战。队伍中建议保留至少一只掌握闪光术的宝可梦应对岩山隧道等黑暗区域，同时确保主力宝可梦等级达到50级以上以应对火箭队精英成员。
最终返回华蓝市洞穴收服超梦标志四之岛任务线完结。该阶段可开始筹备二周目挑战，包括七之岛全区域探索和战斗边疆挑战。宝可梦培养方面建议优先完成技能机配置，重点获取地震、精神干扰等高威力技能以应对后续更高难度的对战。
