结局的选择主要取决于主线任务夜曲OP.55N.1的关键对话选项，以及玩家在游戏过程中完成的支线任务。游戏提供了多个结局分支，包括太阳、节制、星星、恶魔、自杀和隐藏结局，每个结局的触发条件各不相同。玩家需要在最终任务前完成特定角色的支线任务，才能解锁对应的结局选项。与强尼·银手的关系也会影响部分结局的走向，因此在关键对话中需谨慎选择。
若要触发星星结局，玩家必须完成帕南的所有支线任务，包括冲破风暴举手之劳和公路之歌。在夜曲OP.55N.1任务中，选择向帕南求助并服下阻断剂，最终在赛博空间中选择让V回到自己的身体。这一结局被认为是较为理想的结局之一，V将与流浪者部落一同离开夜之城。而太阳结局则需要完成罗格的支线任务，并在最终选择中与罗格合作，击败亚当·重锤后留在赛博空间。
恶魔结局的触发条件较为特殊，玩家需在最终任务中选择相信荒坂公司并服下阻断剂。这一结局分为两个分支，签署合同将使V的意识永远被荒坂控制，而拒绝签署则会让V返回地球，但最终仍会因病情恶化死亡。隐藏结局的触发难度较高，需要在强尼的墓志铭选择中骂他，并在最终对话中等待五分钟，随后选择独自袭击荒坂塔。该结局战斗难度极大，且无法中途存档。
自杀结局的触发方式相对简单，只需在夜曲OP.55N.1任务中选择扔掉药片即可。这一结局较为沉重，V将直接结束自己的生命。而节制结局则需在击败亚当·重锤后，选择将身体留给强尼，自己进入赛博空间。每个结局都会对夜之城的未来和角色关系产生不同影响，玩家可根据自己的游戏风格和剧情偏好进行选择。
