雷立方机关是原神中常见的解谜元素，主要分布在稻妻地区的鹤观岛、珊瑚宫等区域。这类机关通常由多个可旋转的立方体组成，玩家需要通过攻击调整立方体的朝向或点亮特定纹路来完成解谜。解谜成功后一般会获得宝箱奖励，包含原石、武器强化素材等物品。
鹤观岛共有八处雷立方机关，每处解法各不相同。知比山的第一处机关所有石块都朝向内侧，使用弓箭手射击上方的石头即可破解。第二处机关三个石块叠放，攻击顺序应为从下到上依次调整。千来神祠的机关需要按照标记顺序分别攻击1、2、3、1号立方。菅名山山腰位置的机关需注意2号在内侧、4号在碎石堆中，正确攻击顺序为4、3、3、1。逢岳之野的两处机关分别需要调整为全和1同方向后攻击2和5号，以及按照2、4、3、2、1、4的顺序攻击。
珊瑚宫区域的雷立方机关采用数独机制。北、东、南、西四个方向分别对应数字1、2、3、4，带有石块的立方需额外加4。玩家需使每行、每列及对角线数字之和均为15。靠近北方的三个固定立方数字依次为4、3、8（4+4），其余立方需据此推算调整。曚云神社的数独谜题中，2、3、6、7号立方不可旋转，其数值分别为3、4、1、2，需通过逻辑推理确定其他立方的朝向与数值。
雷立方机关主要分为旋转型与点亮型两类。旋转型立方具有特殊花纹面，当两个以上特殊面朝向相同时会亮起，需通过攻击使所有立方亮起。点亮型攻击后会使当前石块及相邻石块共鸣点亮部分纹路，需使所有石块点亮纹路数量一致。弓箭角色便于精准攻击特定立方，钟离的岩柱共鸣可同时影响多个立方。部分机关需先清除周边敌人或碎石障碍，如菅名山机关需用大剑角色击碎岩石堆。
